土壤盐分过高破坏正常的新陈代谢，过多的盐会抑制叶绿素的合成和光合器官中各种酶的发生，特别是抑制叶片绿色蛋白的形成。一般来说，在盐分过多的土壤中生长的作物的净光合速率低于轻土壤中的植物。过多的盐对呼吸有影响。在大多数情况下，呼吸作用减弱，一些植物增加盐分来改善呼吸作用，虽然过量盐对植物光合作用和呼吸作用的影响并不一致，但总的趋势是呼吸消耗高，净光合产生速率低，不利于生长。土壤盐分过高对植物生长还有哪些危害？
一、生理干旱。土壤中可溶性盐类过多，由于渗透势增高而使土壤水势降低，根据水从高水势向低水势流动的原理，根细胞的水势必须低于周围介质的水势才能吸水，所以土壤盐分愈多根吸水愈困难，甚至体内水分有外渗的危险。因而盐害的通常表现实际上是一个旱害，尤其在大气相对湿度低的情况下，随蒸腾加强，盐害更为严重。
二、离子的毒害作用。植物由于吸收某种盐类过多而排斥了对另一些营养元素吸收，当然,单盐的毒害作用可以通过离子拮抗而消除，盐害的发生...究竟是由于盐分过多造成生理干旱，或者由于盐的直接影响也可以区分，假若是渗透势的关系，那么各种溶质的作用是一至的，如果是盐类的直接危害，不同溶质就会产生不同的作用。
土壤盐分的增加与人们的施肥习惯密切相关。一些农民渴望改善碱性土壤。强酸性肥料的施用导致土壤盐分急剧增加，破坏土壤;要从根本上解决土壤的盐碱化问题，施用腐殖酸或黄腐酸肥料，才能使土壤真正恢复健康。
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